Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS | 9105025402014 | Mikrobiyal Ekolojide Moleküler Yöntemler | Seçmeli | 1 | 2 | 8 |
|
Dersin Seviyesi |
Yüksek Lisans |
Dersin Sunulduğu Dil |
Türkçe |
Dersin Amacı |
Bu dersin amacı, moleküler mikrobiyal Ekolojide en yeni pratik ve teorik uygulamaları gerçekleştirmektir |
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri |
Prof.Dr. Güven Özdemir |
Öğrenme Çıktıları |
1 | Çevresel örneklerde bulunan mikroorganizmaların moleküler analizlerini PCR, klonlama, dizileme kıyaslaması, FISH, DGGE…) gerçekleştirebilirler. | 2 | Mikrobiyal toplulukların anahtar organizmalarını tanılayabilirler ve sayısallandırabilirler | 3 | Farklı moleküler ve mikrobiyolojik analizlerin kuvvetli ve zayıf yönlerini açıklayabilirler | 4 | Mikrobiyal ekolojide rastlanan problemlere moleküler mikrobiyal ekoloji kavramlarını uygulayabilirler |
|
Öğrenim Türü |
Örgün Öğretim |
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler |
|
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar |
Yok |
Dersin İçeriği |
Mikrobiyal ekolojide moleküler devri; mikrobiyal çeşitlilik; rRNA yaklaşımı
Mikropların moleküler tanılamada ve kantifikasyonunda son yenilikler
Gen veritabanları ile çalışma, klon kütüphaneleri genetik finger printler
Gen probları literatürleri ve web dünyası; probe dizaynı/değerlendirme |
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği |
|
1 | Çevresel Örneklerde Nükleik asit ekstraksiyonu | | | 2 | Prokaryotik sistematiği: 16S rRNA PCR’ı and dizileme analizleri | | | 3 | Prokaryotik sistematiği: 16S rRNA PCR’ı and dizileme analizleri | | | 4 | Jenerasyon ve klon kütüphane analizleri | | | 5 | Klon kütüphanelerinin kantitatif analizler ve coverage | | | 6 | Klon kütüphanelerinin kantitatif analizler ve coverage | | | 7 | arasınav | | | 8 | Filogenetik inference | | | 9 | Filogenetik inference | | | 10 | Farklı moleküler tekniklere kıyasla filogenetik analizler | | | 11 | Mikrobiyal toplulukların DNA parmak izi | | | 12 | Çevresel izolatların moleküler tiplendirmesi | | | 13 | Çevresel izolatların moleküler tiplendirmesi | | | 14 | Çevresel izolatların moleküler tiplendirmesi | | | 15 | Çevresel izolatların moleküler tiplendirmesi | | | 16 | Final | | |
|
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
1- Molecular microbial ecology. Mark Osborn and Cindy Smith (eds).
Published/Created: New York, NY : Taylor & Francis, c2005.
2- Madigan, M.T., Bender, K.S., Buckley, D.H., Sattley, W.M., Stahl, D.A., "Brock Biology of Microorganisms (15th Edition)"Benjamin Cummings, 2018.
|
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları |
Etkinlikler ayrıntılı olarak "Değerlendirme" ve "İş Yükü Hesaplaması" bölümlerinde verilmiştir. |
Değerlendirme | |
Ara Sınav | 1 | 100 | TOPLAM | 100 | |
Final Sınavı | 1 | 100 | TOPLAM | 100 | Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | TOPLAM | 100 |
| Staj Durumu | Yok |
|
İş Yükü Hesaplaması |
|
Ara Sınav | 14 | 3 | 42 |
Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
Takım/Grup Çalışması | 14 | 2 | 28 |
Rapor Hazırlama | 1 | 5 | 5 |
Bireysel Çalışma | 30 | 2 | 60 |
Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 4 | 8 | 32 |
Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 5 | 8 | 40 |
Okuma | 15 | 2 | 30 |
|
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi |
|
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek |
|
|
Ege University, Bornova - İzmir / TURKEY • Phone: +90 232 311 10 10 • e-mail: intrec@mail.ege.edu.tr |